Przyczyn bezdechu sennego jest wiele. W trakcie snu napięcie mięśni ulega zmniejszeniu, co przyczynia się do zapadania się ścian gardła. Budowa górnych dróg oddechowych ma tu kluczowe znaczenie, ponieważ przy ich nieprawidłowościach dochodzi do bezdechu sennego.
Najczęściej jest to skrzywiona przegroda nosowa lub przerośnięta po infekcjach tkanka. Przyczyną mogą być również polipy lub nieprawidłowa budowa żuchwy. Bezdech senny występuje w również u osób z otyłością lub nałogowo palących papierosy. Jak wskazują badania picie alkoholu oraz objadanie się przed snem może mieć wpływ na pojawiającą się tę przypadłość. Bezdech senny często pojawia się też u osób z nieleczoną niedoczynnością tarczycy oraz chorych na akromegalię. W celu pozbycia się przypadków ograniczenia przepływu powietrza podczas snu zaleca się stosowanie przyrządów tj. aparaty CPAP.
